La historia de Halo: ODST transcurre entre Halo 2 y Halo 3, cuando un escuadrón de ODST (Orbital Drop Shock Troopers), tropas de elite humanas, es mandado a tomar una nave del enemigo Covenant que se encuentra situada sobre Nueva Mombasa. Durante la toma, la nave Covenant realiza un salto estelar, y el escuadrón ODST aterriza desperdigado por varios puntos de la ciudad.